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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00200 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  24 lines
  1. *******************************************
  2. * Tubulin-beta mRNA autoregulation signal *
  3. *******************************************
  4.  
  5. The stability of beta-tubulin mRNAs are autoregulated by their own translation
  6. product [1].  Unpolymerized  tubulin  subunits  bind  directly  (or activate a
  7. factor(s) which binds  co-translationally)  to the nascent N-terminus of beta-
  8. tubulin. This binding is transduced through the adjacent ribosomes to activate
  9. an RNAse that degrades the polysome-bound mRNA.    The recognition element has
  10. been shown to be  the first four amino acids of beta-tubulin: Met-Arg-Glu-Ile.
  11. Mutations to this sequence abolish the  autoregulation effect  (except for the
  12. replacement of Glu by Asp);  transposition of  this sequence  to  an  internal
  13. region of a polypeptide also suppresses the autoregulatory effect.
  14.  
  15. -Consensus pattern: <M-R-[DE]-[IL]
  16. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL,  except
  17.  for soybean beta-2 tubulin which has Ser in the last position of the pattern.
  18. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: a number of alpha-tubulins, as well
  19.  as 9 other proteins.
  20. -Last update: May 1991 / Pattern and text revised.
  21.  
  22. [ 1] Cleveland D.W.
  23.      Trends Biochem. Sci. 13:339-343(1988).
  24.